磁系设计的关键是根据设计磁选机的实际用途选择合适的磁系形式，再结合不同的磁系形式，设计优的磁系结构参数。根据磁场矿物分选基本原理，国内外磁选机磁系设计生产经验以及矿山企业磁选机分选的实践表明，磁选机磁系设计应遵循以下几个基本原则:
(1)磁路设计要尽可能的短。
在磁路计算中，磁路等效于导线，磁路越长，磁路中的磁阻就越大，导致作业气隙两端的磁动势越小，作用在分选空间的磁场强度不高:反之，磁系磁路越短，磁通路的磁阻就越小，作用在分选空间两端的磁动势就越高，产生在作业空间的磁场强度就越高。
(2)作业气隙要尽可能的小。
空气为磁路中的主要磁阻部分，磁阻与空气路径长度成正比。气隙越大，磁路中的磁阻就越大，气隙中的磁场强度就越低;反之，气隙越小，磁阻就越小，气隙中的磁场强度就越大。然而过小的气隙空间不利于分选作业，易造成矿物堵塞，降低磁选设备处理量。因此，在防止矿物堵塞，保证磁选设备处理量的条件下，尽可能的减小气隙空间，增大气隙中的磁场强度。
(3)磁路中的漏磁要尽可能的小。
磁系周围的空气分为有效区域和无效区域。气隙中作为有效分选空间，其间的空气区域为有效磁选区域;而其他区域的空气不在分选空间中为无效区域，其间的磁场为无效磁场，称之为漏磁。
由于磁系设计及装配的缺陷，总会造成一部分磁场在无效区域产生，而不是作业气隙，就产生了磁漏。根据能量守恒原理，漏磁的产生降低了磁系的磁能，导致气隙磁场的磁场强度降低。因此，通过聚磁技术将尽可能多的磁场聚集在作业气隙中，从而有效提高作业气隙的磁场强度。
磁路中漏磁的量化是通过漏磁系数大小来表示，漏磁系数表示为磁路中的总磁通量与作业磁通量的比值。
对于简单磁路，漏磁系数取值一般在1.3-3.0之间，开放式磁系漏磁系数取值较大，闭合式磁系漏磁系数取值较小。
永磁磁选设备传统的磁系磁路设计步骤一般包括:磁系形式选择，磁系结构设计，佳结构参数确定和作业气隙中磁感应强度验算。但随着计算机技术的不断发展，现代磁选设备磁路设计还引入了计算机磁场仿真技术，提高了磁选机设计效率和设计精度。
磁路设计即利用等效电路原理，应用相当于电动势的永磁体产生的磁通在封闭磁路中的连续性原理和磁场在空间区域的可叠加原理。盘式磁选机磁路设计即将磁盘上的几个磁路设计成多个齿极，增加了分选区域的磁场梯度和深度，同时还增加了磁盘的有效分选面积。
磁路计算是磁系设计的基础，其主要任务是依据磁路欧姆定律确定磁系磁路中的磁势，磁路欧姆定律即为磁路中的总磁阻等于磁路中的磁动势与磁通量的比值。
